写于 2016-11-09 07:01:07| 澳门娱乐场登陆网址| 股票

在能源部橡树岭国家实验室开发的扫描分子数据库的速度更快,成本更低,可以让科学家们快速开发出新的药物治疗方法

由田纳西大学ORNL分子生物物理中心的杰罗姆·博德里领导的研究小组采用了一种广泛使用的现有软件,允许ORNL的捷豹等超级计算机筛选大量的分子数据库,并将化学化合物定位为潜在的候选药物

该研究发表在“计算化学杂志”上,作为“Autodock4的任务并行MPI实现,用于使用高性能超级计算机对接非常大的化合物数据库

”“我们的研究是超级计算机与大量数据之间缺失的联系

像人类基因组计划这样的分子数据库,“Baudry说

“我们可以获得大量数据,现在我们需要将这些数据转化为知识

”这种翻译对药物开发的第一阶段至关重要,研究人员寻找与体内靶标相互作用的适当化学物质

,通常是蛋白质

如果化学品是合适的,它会附着在蛋白质上并在细胞中产生理想的效果

但是,随着数千种已知蛋白质和数百万种化学品成为潜在药物,可能的组合数量是天文数字

“通过实验测量这些相互作用是非常昂贵和耗时的,”Baudry说

“但是使用超级计算机,我们每天可以处理数百万个分子

”快速有效的分子处理为科学家们提供了一个机会,可以对先前未经检验的候选药物进行风险处理,这可能导致各种各样的创新药物

“之前,我们丢掉了很多信息,因为分子没有首选的特征,”Baudry说

“现在,每个分子都可以进行检查,而不必担心会浪费资源

”研究人员已经开始通过美国国立卫生研究院支持的新合作将研究推向现实

项目团队计划将计算开发用于ORNL超级计算机,以寻找可治疗前列腺癌的化学物质

该研究由NIH临床转化科学奖资助,该奖项授予Georgetown和Howard大学,并包括ORNL,Med / Star Health和华盛顿特区退伍军人事务医疗中心作为主要合作伙伴

“我们的开发工作相当于建造土星五号火箭,”Baudry说

“现在我们想把它飞到月球上

”ORNL的实验室指导研究和开发计划提供了初步开发工作的资金

田纳西大学和联合UT / ORNL基因组科学与技术研究生课程也支持这项工作

研究小组包括UT-ORNL分子生物物理中心的Barbara Collignon,Roland Schulz和Jeremy Smith

三位研究人员以及Baudry也隶属于田纳西大学生物化学与细胞与分子生物学系

ORNL由UT-Battelle为能源部科学办公室管理

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作者:相炳免